洋葱内表皮和外表皮主要有以下区别：

1、洋葱内表皮细胞无色，相对外表皮更透明，因此可用来做观察DNA与RNA分布的实验。其在显微镜下背景无色，可观察红色和蓝色对象。而洋葱外表皮细胞液泡呈紫色，更易观察到现象，常用来做质壁分离实验。其便于观察液泡的体积变化。

2、洋葱内表皮可增殖分化，而外表皮不可以分裂。