原因如下：

1、刷干净的鞋子晾晒的时候如果被阳光长时间直射，鞋子表面会被晒黄；

2、刷鞋子后残留的水分中还有脏东西，如蛋白。

注：当晾晒时，表层水分先蒸发，鞋子里面含水量高于表层，水分会由内向外运动，水中溶解的脏东西会随着水分的运动向鞋子表层聚集，水分蒸发后，脏物质留在了鞋子表面，如果鞋子用卫生纸包紧，脏物质会残留在表层的卫生纸上。