苗高10-15厘米时，追肥1次，施用量为每亩用人畜粪水1500-2000千克。6月底-7月初，每亩追施过磷酸钙20千克、尿素5千克，行间开沟施下，覆土后浇水。次年收获的待植株枯萎后，于行间开沟每亩追施腐熟厩肥2000千克、过磷酸钙20千克、尿素5千克、草木灰150千克，然后覆土盖平。黄芩耐旱怕涝，雨季需注意排水，田间不可积水，否则易烂根。遇严重干旱时或追肥后，可适当浇水。病害有叶枯病，可清洁田园，发端正初期喷洒1：1：200波尔多液，或用50%多菌灵1000倍液防治。根腐病，注意排水，实行轮作；及早拨出病株烧毁，病株处土壤用石灰消毒。虫害有黄芩舞蛾，可用90%敌百虫防治。