相同点:都严格限制对外交往，只允许部分官方主持的贸易；都不利于中外经济、文化的交流，妨碍了中国海外市场的开拓，阻碍了资本主义萌芽的滋长，造成中国落后于世界潮流，是近代中国落后挨打的重要原因之一。

不同点:明朝海禁主要是针对倭寇，而清朝闭关锁国先是针对东南沿海抗清势力，后来主要用于防范西方殖民者。