建文帝的下落为葬身于火海。燕王破城，建文帝下令焚宫，携皇后马氏，跳入火中自焚。

《成祖本纪》说：“宫中火起，帝不知所终。燕王遣中使出帝后尸于火中”。

《太宗实录》云：“遂阖宫自已焚燃。上望见宫中烟起，急遣中使往救，至已不及，中使出其尸于火中，还白上，上哭曰，果然，若是痴呆耶！”

《明史·建文皇帝本纪》云：“上入宫，忽火发，皇后马氏暴崩，程济奉上变僧服遁去。燕王遂入宫因指烬中后骨以为上！”。