用钉钉打电话扣费了的原因有以下两种：

1、打电话超时了，个人用户最多每个月60分钟，非认证企业用户最多每个月300分钟，认证企业最多每个月1000分钟；

2、若打电话有相关的费用，例如漫游接听费，则可能由运营商收取这部分费用，钉钉本身不收取任何费用。