有。线粒体基质中含有少量双链环状DNA分子和核糖体，可进行DNA复制和合成部分蛋白质，即线粒体有一套自身的遗传系统。但线粒体中DNA的复制受细胞核的控制，并且在线粒体中合成的蛋白质只占线粒体蛋白质总量的一小部分，即线粒体的遗传系统仍要依赖于细胞核。