合同纠纷保存证据应该对《合同书》及有关协议，以及当事人约定纳入合同内容的有关资料完整保存。在合同履行过程中当事人向对方履行了合同的证据要保存。在合同履行过程中向对方发送的告知、通知、提出的异议。

【法律依据】

《民事诉讼法》第六十三条规定，证据包括：

（一）当事人的陈述；

（二）书证；

（三）物证；

（四）视听资料；

（五）电子数据；

（六）证人证言；

（七）鉴定意见；

（八）勘验笔录。

证据必须查证属实，才能作为认定事实的根据。