军婚婚检不合格不能结婚。按照法律规定，军婚是强制婚检，普通人群自愿婚检。婚检项目婚前检查是一次全面系统的健康检查，重点是遗传病方面的调查和生殖器官的检查。

《民法典》第一千零四十九条：要求结婚的男女双方应当亲自到婚姻登记机关申请结婚登记。符合本法规定的，予以登记，发给结婚证。完成结婚登记，即确立婚姻关系。未办理结婚登记的，应当补办登记。