工程合同管理制度的内容有：

(一)目的

(二)适用范围

(三)职责

(四)合同的签订

(五)合同的变更、解除

(六)合同的履行

(七)经济合同纠纷的调解、仲裁和诉讼

(八)合同的日常管理

(九)考核与奖惩

(十)附则

【法律依据】

《工程施工合同管理制度》第一条，为加强集团公司合同及合同文件档案管理工作,维护企业自身合法权益,强化集团公司经营管理,适应市场经济竞争和发展的需求，制定本制度。