沈阳药科大学高等职业技术学院是药科大学的二级学院。学院位于铁西区北一西路，占地面积为2万多平方米，建筑面积1万多平方米。学院现有教职工人数169人。其中专任教师73人；教授、副教授33人；中级职称及以下40人。研究生17人，硕士在读19人，博士在读3人。教辅14人，图书情报人员10人，辅导员教师10人。其余为行政管理人员及工人。

沈阳药科大学高等职业技术学院，由原辽宁省医疗器械学校演变而来。学院分为药学系、医疗器械系、基础部二系一部和一个实训教学中心。设有11个专业：医用电子仪器与维护、医疗器械制造与维护、药物制剂技术、药学、药物分析、电子商务、生物制药、药品经营与管理、制药设备维修技术、中药制药技术、中药应用技术，有13个教研室。