国防部部长和军区司令相比，国防部部长权力大，国防部统领各大军区。军区的总司令是军区最高领导，国防部长比军区司令级别高。国防部长属于政府体系，政府领导军队的。

国防部是中华人民共和国国务院的军事部门。根据中华人民共和国宪法规定，国务院领导和管理国防建设事业。国务院设立国防部，一切需要由政府负责的军事工作，则经国务院作出相应决定，通过国防部或以国防部的名义组织实施。国防部在接受国务院领导的同时也接受中央军事委员会的领导。