确认国家赔偿申请是否有效的方式是只要是在规定的时效内提出的国家赔偿申请一-般都是有效的。赔偿请求人请求国家赔偿的时效为两年，自国家机关及其工作人员行使职权时的行为被依法确认为违法之日起计算，但被羁押期间不计算在内。

【法律依据】

根据《国家赔偿法》第七条，行政机关及其工作人员行使行政职权侵犯公民、法人和其他组织的合法权益造成损害的，该行政机关为赔偿义务机关。