双歧杆菌目前不能用来发酵馒头。

双歧杆菌属于厌氧的细菌，发酵的特点是利用葡萄糖产乙酸和乳酸，但是不产生二氧化碳，而馒头需要借助气体才能发酵膨胀，常用的发酵馒头的材料有苏打粉、发酵面等。

鉴于双歧杆菌具有的优良功能性质，人们也开发出一系列的双歧杆菌的不同菌株，并将这些菌株用在食品上。常见的在食品生产中应用的双歧杆菌菌株包括动物双歧杆菌乳酸亚种、短双歧杆菌、长双歧杆菌等。产品形式包括发酵乳、含双歧杆菌奶粉、巧克力、膳食补充剂等。