第一，甲胎蛋白正常值偏高有可能是肝癌引起的，有肝癌疾病的人血清中升高甲胎蛋白都会升高。甲胎蛋白在肝癌出现症状之前的8个月就已经升高，此时大多数肝癌病人仍无明显症状，肿瘤也较小，这部分人只有经过手术治疗后，预后可得到明显改善。

第二，妊娠妇女和新生儿也会出现甲胎蛋白的一时性升高，甲胎蛋白是胎儿的正常血浆蛋白成分，妊娠期妇女甲胎蛋白是会明显升高，在产后3周后逐渐恢复正常水平。

第三，其中肝损伤、充血性肝肿大、毛细血管扩张症、先天性酪氨酸病、睾丸或卵巢胚胎性肿瘤（如精原细胞瘤、恶性畸胎瘤、卵巢癌等）也常有甲胎蛋白增高。