以下证据可以证明夫妻分居多年：

1、一方在外居住的房屋租赁合同；

2、双方签订的夫妻分居书面协议，一定是要书面的，口头协议必须对方承认；

3、一方向另一方发出的书面分居文书，最好是用快件性质邮寄，在备注栏里注明“分居”，并且保留邮寄凭证，从邮寄之日起到提起离婚期间属于夫妻分居时间；

4、双方来往的书信、电子邮件等能证明双方感情不和分居的事实。

《民事诉讼法》第六十三条规定，证据包括：

（一）当事人的陈述；

（二）书证；

（三）物证；

（四）视听资料；

（五）电子数据；

（六）证人证言；

（七）鉴定意见；

（八）勘验笔录。

证据必须查证属实，才能作为认定事实的根据。