首发基金是为首都医学发展科研基金的简称。北京市在实施医药费总量控制，结构调整的改革中，设立首都医学发展科研基金。其宗旨是通过科技创新，体制创新，建立多学科、多中心的合作研究网络及有效的团队合作机制。支持首都地区的医疗卫生机构开展医学卫生领域的应用科学研究，有效推广应用科研成果，促进医学卫生领域的人力资源开发，进一步提高首都地区预防，保健，治疗和康复的整体科研水平和技术水平，提高对北京地区的重大健康问题和主要疾病的预防控制水平，满足人民的健康需求；同时支持开展与医药卫生体制改革相关的卫生管理学、卫生经济学等软科学的研究，提高医疗卫生机构的管理能力和水平。