首先：人参健脾丸与人参归脾丸均属两者均含人参、茯苓、白术、黄芪以益气健脾;含木香理气健脾、调理中焦气机;含酸枣仁、远志安神定志;含当归活血养血。其实，人参健脾丸还含有山药、陈皮、砂仁加强健脾和胃作用;人参归脾丸另有龙眼肉、炙甘草补血和营。

其次：同样药物的用量也有所不同，人参健脾丸重用黄芪、山药，意在健脾益气;人参归脾丸重用当归、人参养血益气。

最后：在具体的功效与作用上，人参归脾丸和人参健脾丸也是不一样的，一般来说，人参健脾丸具有健脾益气、和胃止泻的功效，主要用于脾胃虚弱引起的恶心呕吐、腹痛便溏、不思饮食、体弱倦怠。人参归脾丸具有益气补血，健脾养心的功效，主要用于心脾两虚，气血不足所致的心悸，失眠健忘，食少体倦，面色萎黄所致的便血、崩漏、带下诸症。