该学校设有临床学院、基础学院、特教学院、口腔学院、护理学院、医学人文学院、中西医结合学院、药学院、卫生管理学院、成人教育学院等10个院。滨州校区设有的专业具体如下：

1、临床医学院设有临床医学，临床医学，医学影像学，麻醉学，医学检验，眼视光学；

2、护理学院设有护理学；

3、人文与社会科学学院设有法学、应用心理学；

4、中西医结合学院设有中医学、中药学。