增值税发票号码开错了，要按照《增值税专用发票使用规定》相关程序处理，重新开正确的发票。

《增值税专用发票使用规定》第十四条至第十九条有明文规定，需要由对方税务局出具《开具红字增值税专用发票通知单》，你方凭此《通知单》方能开具负数发票，否则你方不能开具负数发票，也就不能冲减当期销售。

让收票单位开一个红字发票证明,在证明上说明那里开错了,并注明正确的应开什么,并说明这个增值税发票对方没有做过进项认证,并退回给你们公司重新开票,证明需他们盖公司公章的,把这张证明的原件的和发票一起带到税务局,重新开正确的发票。