对司法鉴定有争议的处理办法是：

(一)坚持申请重新鉴定。

(二)向司法行政机关投诉反映，以达到撤销违法司法鉴定结论的目的。

(三)主动搜集其他证据推翻鉴定结论，使得鉴定结论不能作为定案证据。

【法律依据】

《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第二十七条规定，当事人对司法鉴定结论有异议申请重新鉴定，需提出证据证明存在下列情形之一：

(一)鉴定机构或者鉴定人员不具备相关的鉴定资格的;

(二)鉴定程序严重违法的;

(三)鉴定结论明显依据不足的;

(四)经过质证认定不能作为证据使用的其他情形。