水样采集只是环境分析监测中的一个步骤，与后继的分析测定步骤相比，采样工具的精确程度远比不上分析仪器，采样过程的严密程度也比不上分析过程；生物作用：细菌藻类及其它生物体的新陈代谢会消耗水样的某些组分，产生新的组分，改变一些组分的性质，生物作用对样品中待测的一些项目的含量和浓度产生影响；化学作用：水样各组分间可能发生化学反应，从而改变某些组分的含量和性质；物理作用：光照温度震荡敞露密封等保存条件及容器材质都会影响水样的性质。如温度升高或强震荡会使一些物质如氧、氰化物及汞的挥发；长期静置会使Al(OH)3、CaCO3、Mg3(PO4)2等沉淀。另外某些容器的内壁能不可逆吸附或吸收一些有机物和金属化合物等。