软件著作权登记的程序：1、申请咨询、洽谈；2、签订申请委托代理合同、缴纳申请费用；3、委托人提交相关材料、并填写申请表格；4、专业人员整理审核材料；5、委托人审核申请文件并签字；6、提交申请。

申请流程及时间（仅指传统申请）：申请——受理(约1个月)——中国版权保护中心软件登记部门再行审核(约2-3个月)——领证（共约4-6个月）