行政事业单位房产出租纳税房租应按5%缴纳营业税，其次是否应交房土税要分情况：

1、出租方和承租方均为房土税免税单位，不交房土税。

2、出租方为房土税免税单位，承租方为纳税单位，由出租方按租金缴纳房土税。

3、出租方为房土税纳税单位，由出租方按房产原值缴纳房土税行政事业单位若有财政拨款，即为房土税免税单位。