孙中山定都南京原因：

第一，南京是六朝古都，文章锦绣地，温柔富贵乡。

第二，南京在清代是江苏省的政治中心和文化中心。

第三，作为政治中心和由于自身地理位置的优越性，南京是江南地区的经济重镇。鸦片战争后，由于各种原因，南京的经济地位下降，但仍然是江苏省的政治中心和文化中心。

第四，南京离上海很近，而上海在清朝前期就是一个交通商业重镇，“江宁条约”被辟为通商口岸之后，由于其优越的地理位置，发展迅速，洋务运动后，成为全国最大的工商业城市。