1、海淀区第二实验小学成立于1999年5月7日，它由原清河二小，清宁路小学合并而成，且先期合并了原朱房小学和安宁庄小学，办学基础较好，目前有四个校区，橡树校区，朱房校区，清宁校区，当代校区。

2、2010年橡树湾小区投资扩建该校校区，修建可容纳800人同时就餐的食堂，增建室内篮球馆，扩建图书馆，将一圈仅仅有150米的原操场废弃，修建了一个一圈400米的标准操场，这次扩建将海淀区第二实验小学建成海淀区硬件设备一流的小学。

3、学校以全面贯彻党的教育方针为宗旨，坚持全面育人，教有特色，全面发展，学有特长的办学思想，以科研为先导，深化教学改革，务本求实抓质量为学校教学工作之魂。

4、2000年12月，学校被海淀区教委授予海淀区学校艺术教育先进集体称号，2001年，学校被评为全国创造教育先进集体和先进教科室。