两者是近义词，总体上词意相近，具体区别为：断章取义是指错误的做法，以偏概全则是指错误的结果。

断章取义，汉语成语，指不顾全篇文章或谈话的内容，孤立地取其中的一段或一句的意思，指引用与原意不符。该成语出自《左传·襄公二十八年》:"赋诗断章，余取所求焉"。

以偏概全，指用片面的观点看待整体问题。出自吴家国《普通逻辑》:"只有分析地阅读，才能学得深透，不致囫囵吞枣，一知半解;只有综合地阅读，才能学得完整系统，不致断章取义，以偏概全"。