主要看侵占金额，如果金额达到入罪金额的话，依然会定罪处罚。

根据《刑法》规定，职务侵占一旦构成立案标准司法系统介入，就不会因公司不追究而销案，还钱与公司不追究只能作为量刑情节，从轻处罚，其侵占行为已触犯了刑法，依法要定罪量刑。

【法律依据】

《刑法》第二百七十一条公司、企业或者其他单位的人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的，处5年以下有期徒刑或者拘役;数额巨大的，处5年以上的有期徒刑，可以并处没收财产。

国有公司、企业或者其他国有单位中从事公务的人员和国有公司、企业或者其他国有单位委派到非国有公司、企业以及其他单位从事公务的人员有前款行为的，依照本法第三百八十二条、第三百八十三条的规定定罪处罚。