2002年06月，摩根士丹利等机构投资者在开曼群岛注册了开曼公司。2002年09月，蒙牛乳业的发起人在英属维尔京群岛注册成立了金牛公司。同日蒙牛乳业的投资人、业务联系人和雇员注册成立了银牛公司。

2009年7月，中粮投资61亿港元收购蒙牛20%的股权，中粮成为蒙牛第一大股东。

2008年09月19日，国家质量监督检验检疫总局撤销内蒙古蒙牛乳业集团股份有限公司液态奶产品中国名牌产品称号。

2013年6月18日，中国蒙牛乳业有限公司与雅士利国际控股有限公司联合宣布，蒙牛乳业向雅士利所有股东发出要约收购。

2016年09月15日，卢敏放出任蒙牛乳业总裁。原蒙牛乳业总裁孙伊萍已辞任。

2017年07月12日，2017年“全球乳业20强”榜单，蒙牛跃居榜单前10强，排名上升一位。