在变动成本方面，由于粮食价格的上涨，用玉米生产燃料乙醇的原料成本居高不下。按照行业平均水平，每3、3吨玉米可以生产出1吨燃料乙醇。以2007年1~6月的市场平均价格计算，玉米的市场行情为1500~1700元/吨，加上800元左右的加工费、100元的脱水费用和100元的销售费用，每吨燃料乙醇的成本约为5950~6610元。这还不包括由于减少了二氧化碳的排放量，每年可以获得CDM（清洁发展机制）项目资金。

CDM项目的核心内容是允许发达国家应用资金和技术与发展中国家合作，在发展中国家实施生物质能的开发和利用，从而达到减少温室气体排放的目的。