食蚊鱼在鱼缸由雄鱼和雌鱼交配后繁殖，精子由雄鱼交配器送入雌鱼生殖孔，在体内受精、孵化。

初生的幼鱼在水温适宜的条件下，经1个多月达到性成熟，即可开始繁衍后代。繁殖季节为4～10月，最适宜季节为5～9月，每隔30～40天即产仔1次，每次胎产30～50尾，每尾雌鱼每年能产200～300尾。