1、三斑海马含有谷氨酸，天冬氨酸，甘氨酸，脯氨酸，丙氨酸，亮氨酸等十七种氨基酸；钙，磷，钠，钾，镁，铁，锶，硅等十九种无机元素。另外还含有硬脂酸，胆甾醇。此外还推测含有胆甾二醇。

2、刺海马含有蛋白质，脂肪，多种氨基酸。皮肤黄色素为胡萝卜素，红色素为虾青素，剌蛄素，黑色为黑色素。另含乙酰胆碱酯酶，胆碱酯酶，蛋白酶。

3、大海马中含精氨酸，天冬氨酸，丙氨酸，某氨酸，脯氨酸，谷氨酸等二十多种氨基酸，尚含有药用价值较高的牛磺酸。另外还含有大量的钙、镁、钾、钠、铁，较多的锌、锰、铜和少量的铬、钴、硒等无机元素。