海胆发苦的原因有两个，一个是海胆里面明矾放多了，一个是成熟的雌性海胆卵巢特有的苦味。

第一个原因：通常明矾放多了。海胆稍微经过些时间放置，就会融化，为了保持海胆的形状，很多加工厂家会放一些明矾，但有的厂家可能会放多了。其实海蜇也是用明矾来加工的。

第二个原因，生物学上的研究结果。通过对北海道马粪海胆的研究得出结果，成熟的雌性海胆卵巢有的会含有这种苦味的物质，据说是一种苦味氨基酸。

海胆是棘皮动物门下的一个纲，是一类生活在海洋浅水区的无脊椎动物。主要特征为体呈球形、盘形或心脏形，无腕。内骨骼互相愈合，形成一个坚固的壳，多数种类口内具复杂的咀嚼器，称亚里士多德提灯，其上具齿，可咀嚼食物。消化管长管状，盘曲于体内，以藻类、水螅、蠕虫为食。多雌雄异体，个体发育中经海胆幼虫(长腕)，后变态成幼海胆，经1-2年才达性成熟。可分为规则海胆亚纲和不规则海胆亚纲两个亚纲，22目。