并不是说有荚膜的细菌往往有毒，而是因为没有荚膜的细菌很容易被生物体的免疫系统消灭，所以没有荚膜的细菌无法加害生物体，而有荚膜的细菌能够抵抗免疫系统，不易被杀灭，所以显得“有毒”。

荚膜具有抗有害物质的损伤作用，就如盔甲一样，因此人体中的溶菌酶一般不起什么作用，人体免疫系统就不易消灭有荚膜的细菌。