易使头发变得乾燥，断裂和容易打结。染发过程会影响头发中水分失衡，和大量蛋白质的变性和减少等。从而导致头发变脆，纤维断裂，失去自然的柔软、韧性和光泽的美感。染发次数越多，发质损伤也越严重。染发剂的急、慢性刺激会引起头皮和毛囊的炎症反应，久了会引起毛囊的萎缩，头发由粗变细，最后脱发掉发。

皮肤过敏反应，是染发最多见的不良反应。染发剂不合格极易引起皮炎，包括接触性皮肤炎，脂漏性皮肤炎，湿疹等。初期会出现养，红肿，痛等症状，若抓破皮则易引发细菌感染。一些人染发初期可能不发生过敏反应，经过数次染发之后，就可能发生过敏反应，用的时间越长，发生过敏的几率越高。

头皮毛囊是毒素进入人体的最佳通道。

含有联苯胺的化学染剂会引起膀胱癌，溶血性贫血和皮肤病变;苯会危害中枢神经，影响造血功能，并造成肌肉崩解，神经病变。吸收有毒物质损伤肝、肾功能。多见于金属染发剂，以及某些合成的有机类染发剂，如含有醋酸铅、硝酸银类，含有苯、萘、酚类等。