1、产地区别。麻椒：麻椒产于贵州、四川和西藏等地，麻味特殊，不香，四川人叫臭花椒”。花椒：花椒产于四川东北丘陵山区，尤以汉源产品为上，色红或紫，味麻香。

2、果实区别。麻椒：麻椒瘤状突起特别明显，果皮在光线下有许多亮点，干麻椒发褐色。花椒：花椒果皮有气孔无瘤状突起，干花椒的颜色发红。

3、树形区别。麻椒：麻椒树形相对紧簇一些，枝条细弱一些。花椒：花椒树形比较松散，枝条较粗壮而长。

4、叶片区别。麻椒：麻椒相对较薄，多为3~5片羽状复叶，且叶柄上有羽状翅。花椒：花椒叶片较厚，多为7~9片羽状复叶，甚至11~13片，叶柄翅上无羽状。

5、色泽区别。麻椒：麻椒颜色浅，偏棕黄色。花椒：花椒颜色重，偏棕红色。

6、口感区别。麻椒：麻椒味道比花椒重，以麻为主，麻时间比较久。花椒：花椒的香味浓烈，但是麻味稍逊色。