科创板打新深市市值是不算的，根据参与科创板打新的条件来看，必须是前20个交易日沪市股票持仓市值达到1万元或以上。这里对于市值的要求是沪市市值，而深市市值与沪市市值又是分开计算的，所以有深市市值不满足科创板打新条件。