1、皮肤和被鳞：水龟的皮肤柔弱，半水龟的被鳞要多。这是因为水龟的活动主要集中在水中，所以皮肤相对较柔弱，像很多棱背龟属的品种皮肤颇为柔弱，水质不当都很容易溃疡腐烂；而半水栖性的品种多活动于沼泽草丛等陆地环境，较发达的皮肤被鳞一方面可以形成保护，同时也可以防止水分流失。像盒龟属的大部分品种四肢鳞片相当发达。

2、指趾间蹼：水龟尤其是高度水栖的品种指趾间蹼很发达，相反半水的就会退化很多。在水中活动的品种，指趾间蹼发达可以利于划水，像咸水龟属的所有品种蹼都相当发达。