玉米的种子主要由种皮、胚乳和胚3部分组成 。

种皮：果皮与种皮紧密相连不易区分，习惯上均称之为种皮。

种皮主要有纤维素构成，表面光滑，一般无色，包围整个种子，约占种子总重量的6%-8%。具有保护种子不受外力机械损伤和防止病虫害入侵的作用。

胚乳：玉米的胚乳位于种皮内部，最外层由单层细胞组成，这些细胞充满含有大量蛋白质的糊粉粒，组成糊粉层。糊粉层下不的胚乳分为粉质胚乳、角质胚乳（二者是由蛋白质所占比例不同来区分的）。