每天刷三次牙的好处是去除牙齿表面和缝隙中存留的的食物残渣、牙垢、菌斑。菌斑中细菌是龋齿和牙周病发生的主要原因。刷牙防龋的重要作用在于通过使用含氟牙膏，牙膏中的活性氟能促进釉质再矿化，并增加牙齿的抗龋能力。科学地讲每次吃东西后都应立即刷牙，因为食物残渣滞留在牙齿上、缝隙里，很快就会与茵斑上的细菌发生作用而侵害牙齿。若刷牙不认真，口腔内遗留的食物残渣仍可同细菌发生作用而引发龋齿。

最新的龋病病因理论认为，牙齿表面某些深窝沟或者不容易刷洗干净的地方容易停留细菌。唾液中的蛋白质、细菌及食物碎属等在牙面上形成一层粘性薄膜，成为细菌生长繁殖的环境，此称为菌斑。食物中的蔗糖分子进入菌斑被细菌利用，可以分解成葡萄糖和果糖。这些糖被细菌发酵，产生酸，酸则将牙齿内的矿物质溶解，从而发生龋。蛀牙是同多种因素有关，包括牙齿的质量、牙齿表面停留的细菌、糖、作用时间等有关。