干酪乳杆菌的发酵培养基可以选用改良TJA培养基、改良MC培养基、MRS培养基等，实际上干酪乳杆菌是乳酸菌的一种，只要适用于乳酸菌的培养基都可适用，但是，仅从培养基表面生长的菌落不能将该菌与其他乳杆菌分辨出来，还需要做生化鉴定，如果只是需要在液体中增殖，那么使用普通的脱脂奶粉就可以了，甚至普通奶粉都可以，浓度为百分之十五左右，也可以用固体培养基，然后删除琼脂成分后配置的液体即可，此外，培养基是供微生物、植物组织和动物组织生长和维持用的人工配制的养料，一般都含有碳水化合物、含氮物质、无机盐以及维生素和水等，不同培养基可根据实际需要，添加一些自身无法合成的化合物，即生长因子。