生物体的组成层次是元素，化合物，细胞器，细胞，组织，器官，系统，个体。可以看到，器官是由一群细胞组成的。但是微生物一般都是单细胞生物（像是细菌）或者是较多的细胞群组成的生物（像是放线菌），首先无法有足量的细胞形成系统和器官，其次器官要求有神经系统调节合作，而微生物基本没有神经纤维以及条件反射，只是有基本的体液调节。所以可以视为微生物没有器官和系统。