菌肥和复合肥要分开施用，如果混施会大大降低菌肥的效果。菌肥亦称生物肥、生物肥料、细菌肥料或接种剂等。菌肥有益微生物菌在土壤中繁殖，起到改良土壤、防治病害等功能。复合肥是由化学方法或混合方法制成的含作物营养元素氮、磷、钾中任何两种或三种的化肥。