学院拥有水产科学技术与食品安全福建省高校重点实验室、福建省水产病害防治研究中心、厦门市饲料安全与检测重点实验室、集美大学水域环境与渔业资源监测中心，水产试验场和16个校外本科教学实习基地，现有仪器设备总值2000多万元；

学院与集美大学水产生物技术研究所实行院所合一管理，设有水产养殖学、渔业资源学、营养与饲料学、水生生物学、水产生物病害防治等五个学科。其中水产养殖学为福建省重点学科，渔业资源学、营养与饲料学和水生生物学为集美大学重点学科；

学院承担的国家863计划项目、国家自然科学基金项目、省部级等各级各类科研项目100多项，获得16项省、市级科技进步奖，在国内外多种学术刊物发表学术论文300多篇，其中被SCI、EI、ISTP收录30多篇；

学院紧紧围绕“培养学生创新精神和提高实践能力”的宗旨，不断推进学风建设，积极探索并不断完善以辅导员负责制、“学生导师”制、辅导员助理制为主的一套新形势下大学生政治思想教育工作新机制，高度重视和不断加强大学生党建和思想政治工作，开展丰富多彩的第二课堂活动，形成培育大学生良好人文素养、科学素质的氛围和环境，在“挑战杯”中国大学生创业计划大赛、全国大学生英语竞赛等活动中均取得较好成绩，历届毕业生深受社会和用人单位好评。