在《口袋妖怪》游戏中，复刻水跃鱼在石之洞窟的无底谭中进行捕捉，由于复刻水跃鱼非常稀有，所以捕捉概率只有百分之五。具体的剧情如下：

1、在执行捕捉复刻水跃鱼的任务时，首先需要打败枯叶市电系道馆中的所有妖怪，打完以后可以获得圣安努号的船票。

2、根据地图上的提示，按照路线登上圣安努号轮船，圣安努号轮船会将玩家带到石之洞窟。

3、在石之洞窟的入口处首先打败守护关卡的蛟龙，然后即可进入石之洞窟。

4、然后在石之洞窟中找到无底谭，进入无底谭后使用喷雾剂可以提高遇见复刻水跃鱼的概率。

5、若遇到复刻水跃鱼，玩家在与复刻水跃鱼经过8个回合的相互攻击后即可将其收服，若没有遇见复刻水跃鱼，可将无底谭中的宝珠收走，宝珠会使玩家的攻击力增加百分之十。