蓝藻是最简单、最原始的自养植物类型，它能进行与高等植物类似的光合作用。藻体为单细胞或多细胞群体或丝状体。蓝藻细胞中的原生质体不分化成细胞质和细胞核，而分化成周质和中央质，周质中没有线粒体、叶绿体等细胞器。

蓝藻包括蓝球藻、颤藻、念珠藻等。

蓝藻门分为两纲：色球藻纲和藻殖段纲。色球藻纲藻体为单细胞体或群体；藻殖段纲藻体为丝状体，有藻殖段。蓝藻在地球上大约出现在距今35～33亿年前，已知蓝藻约2000种，中国已有记录的约900种。