马达蛋白的工作原理是分子马达将化学键中的能量耦合转化为动能。而化学键中的能量最终来自细胞膜或线粒体膜内外的电化学梯度。马达蛋白是利用ATP水解所释放的能量驱动自身沿微管或微丝定向运动的蛋白。

马达蛋白是分布于细胞内部或细胞表面的一类蛋白质，它负责细胞内的一部分物质或者整个细胞的宏观运动。生物体内的各种组织、器官乃至整个个体的运动最终都归结为分子马达在微观尺度上的运动。