大便有霉菌的情况主要考虑是菌群失调导致的。比方说滥用一些抗菌药物或者是应用一些抗菌药物，时间比较久，就会引起肠道内菌群的不正常的繁殖而造成感染，容易导致出现一些霉菌的形成。

出现这种情况，主要就是要停止应用抗生素的情况，同时配合用一些治疗霉菌的药物，例如制霉菌素片。同时也需要应用一些益生菌，例如双歧杆菌或者是嗜酸性乳杆菌等来调节肠道的菌群，有利于防止霉菌进一步加重。