大小和卓是乾隆皇帝平定的。大小和卓是指生活在天山南麓的维吾尔族牧民的两个首领，和卓一般是伊斯兰教民众对有威望的人的尊称，大和卓木名叫布那敦，小和卓木名叫霍集占，二人为兄弟关系。清平大小和卓之战即清乾隆二十二年（1757年）清政府平定新疆回部（天山南路）白山派首领霍集占兄弟叛乱的斗争。

乾隆二十年（1755年）清军平定准噶尔后，将被囚禁的大小和卓释放，并派波罗尼都招抚天山南路各城。不久阿睦尔撒纳发动叛乱，和卓兄弟乘机控制了喀什噶尔、叶尔羌（今新疆莎车）等地。乾隆二十二年（1757年），霍集占杀死清军副都统阿敏道，举兵自立。次年（1758年），乾隆皇帝发兵征讨大小和卓，在库车、叶尔羌、和阗等地与大小和卓交战。乾隆二十四年（1759年），大小和卓兵败西逃，经葱岭进入巴达克山（在今阿富汗东北部），被巴达克山首领素勒坦沙擒杀，叛乱遂平。大小和卓之乱的平定标志着清代中国统一战争的完成，也是乾隆帝的十全武功之一。

此役之后，天山南路重新纳入中国版图，清代中国疆域臻于极盛。回部平定后，清廷设伊犁将军统辖新疆各部，设总理回疆事务参赞大臣管理回部。此后的六十多年中新疆没有发生大的动乱。